เปิดประเด็น Algebraic Biology

โดยการชักนำของ Dr.River
เกิดมาก็เพิ่งจะเคยได้ยินเนี่ยแหละ เริ่มด้วยเซิชใน google และเว็บแรกที่ออกมาก็คือ wikipedia แหม๊ ไม่เสียแรงที่ช่วยบริจาคให้เค้าไปด้วย ก็อยากให้โลกของเรามีทุกสิ่งที่เราอยากรู้บ้าง อะไรบ้าง

ม่ะ เป็นยังไง ไปดู
Algebraic Biology ก็คือการ การใช้วิธีการทางพีชคณิต(พวกโอเปอร์เรชันต่าง ๆ)มาจัดการกับปัญหาทางชีววิทยา โดยเฉพาะในปัญหาของ genomic, proteomic การวิเคราะห์โครงสร้างของโมเลกุล และการศึกษาเรื่องยีน เป็นไงล่า งงไปเลย 555

เอาเท่านี้ก่อน ราตรีสวัสดิ์พี่น้องชาวไทย

ปล. เว็บ bioin4.com เจ๊ง ขี้เกียจแก้จังเลยยยยยย....

Kernel based method : SVM

พูดถึงในทาง bioinformatics ข้อมูลก็จะเป็น biological sequence ซึ่งก็คือ สายลำดับ DNA, RNA หรือ โปรตีนอะนะ
SVM (Support Vector Machine) เป็นอัลกอริธึ่มที่ใช้ฟังก์ชั่นเคอเนล ในการ classification จะใช้ kernel fucntion รูปแบบ k(Si,Sj) ทำตัวห้อยยังไงฟะ ฟังก์ชันเคอเนลจะคำนวณความเหมือนของซีเควนซ์ Si กับ Sj

เคอเนลที่ใช้ก็มีหลายแบบอีก ที่ใช้จัดการกับ biological sequence ก็จะเป็นพวก string kernel

ผลจากการ learning ของ SVM ก็คือค่า อัลฟ่า(α) กับค่าบี(b)

α คือ Weighted linear combination of kernel elements

b คือ bias

พอก่อน ไว้มาต่อ